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| 事務局 |
総務部 |
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| 国際主幹 |
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| 経理課 |
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| 学生課 |
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| 大学院 |
農学研究科
(修士課程) |
生物生産科学専攻 |
| 共生持続社会学専攻 |
| 応用生命化学専攻 |
| 生物制御科学専攻 |
| 環境資源物質科学専攻 |
| 物質循環環境科学専攻 |
| 自然環境保全学専攻 |
| 農業環境工学専攻 |
| 国際環境農学専攻 |
連合農学研究科
(博士課程) |
生物生産学専攻 |
| 生物工学専攻 |
| 資源・環境学専攻 |
岐阜大学大学院連合獣医学研究科
（博士課程・獣医学専攻） |
| 工学研究科 |
（博士前期課程） |
生命工学専攻 |
| 応用化学専攻 |
| 機械システム工学専攻 |
| 物理システム工学専攻 |
| 電気電子工学専攻 |
| 情報コミュニケーション工学専攻 |
| （博士後期課程） |
生命工学専攻 |
| 応用化学専攻 |
| 機械システム工学専攻 |
| 電子情報工学工学専攻 |
| 生物システム応用科学研究科（博士課程） |
生物システム応用科学専攻 |
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